L’équipe est affaiblie par les départs de Viorel Moldovan en fin de contrat et Éric Djemba Djemba, révélé au milieu du terrain cette saison-là et rapidement cédé à Manchester United. La saison débute très bien sur le terrain (7 victoires et une seule défaite sur les dix premières journées), mais l’équipe laisse finalement échapper le titre au profit du Havre. Malgré cette performance, le RC Paris ne parvient pas à se battre pour le titre en championnat, d’autant que certains de ses Pieds-Noirs préfèrent rentrer en Algérie. Après des débuts difficiles en Division 1 malgré un titre de champion de France en 2000, Grégory se fait remarquer lors de son premier passage à l’AC Ajaccio. Lors des matchs retour, ils réalisent une nouvelle série de huit victoires, notamment dus à l’éclosion de Vahirua, irrésistible joker (7 buts) qui offre au club son huitième titre à l’avant-dernière journée face à Saint-Étienne (1-0) le 12 mai. Nicolas Savinaud et Frédéric Da Rocha sont ainsi les deux seuls joueurs du titre de 2001 à demeurer au club.
Avec le départ de Nicolas Savinaud en fin de contrat, seul Frédéric Da Rocha incarne encore la tradition, lui qui a commencé sous Jean-Claude Suaudeau. Le club refait surface en 1913 sous le nom Football Club Valenciennois lorsqu’une nouvelle équipe de dirigeants décide de relancer le football dans la ville. Ibrahima Sissoko réussit à crocheter Moutoussamy dans la surface des canaris, maillot strasbourg avant que Diego Carlos n’arrive par derrière et le fasse tomber. Le FCNA perd deux de ses meilleurs joueurs avant la saison 1995-1996 : Patrice Loko rejoint le PSG, et Christian Karembeu la Sampdoria. 2009-2012 Franck Dumas (& Patrice Garande, entr. La saison 1997-1998 est décevante dans toutes les compétitions (11e en championnat, éliminations précoces en coupes). Emmenée par Sibierski, qui inscrit 23 toutes compétitions confondues, l’équipe connaît néanmoins quelques sommets. ↑ Le premier chiffre correspond au score de l’équipe jouant à domicile. Si les Lyonnais iront tout de même chercher une victoire pour l’honneur en Espagne (2-0, premier but européen de Maxwel Cornet et deuxième but de la saison européenne d’Alexandre Lacazette), la première de l’histoire du club contre Valence, ils finissent derniers avec seulement quatre points (une seule victoire, un nul, quatre défaites) et trois matchs à domicile se soldant par des défaites.
En début d’année 2002, les résultats s’améliorent spectaculairement : le dernier match de Raynald Denoueix aura été le premier d’une série de six rencontres sans défaite, soit seize points pris sur dix-huit possibles. Le FCNA connaît un championnat difficile, terminant douzième mais ne sauvant en fait sa place qu’à la dernière journée via une victoire au Havre dans un match tendu. Juventus en marquant un but, son quarantième dans cette compétition. Le 2 juillet 2008, Guillaume Hoarau reçoit son numéro 9 fétiche qu’il portait déjà au Havre, avec la lourde responsabilité de succéder à Pedro Miguel Pauleta, le meilleur buteur de l’histoire du club parisien prenant sa retraite. Metz se fait surprendre une vingtaine de minutes plus tard par le meilleur buteur nîmois Boubacar Kébé. Dès lors, la tendance s’inverse et le FCNA demeure invaincu pendant 30 journées (à deux matches du record de 1995), Japhet N’Doram inscrit 21 buts, juste derrière le meilleur buteur du championnat Stéphane Guivarc’h (22 buts).
